Windows 環境で MySQL を複数起動させる方法です。サービス登録を行わない場合は、以下のバッチコマンドで起動できます。
C:\home\develop\mysql-5.6\bin\mysqld --defaults-extra-file=C:\home\develop\mysql-5.6\my.ini --standalone --console
my.ini は以下のような設定にしておきます。
[mysqld] port=3307 datadir=C:\home\develop\mysql-5.6\data