project/plugins.sbt
addSbtPlugin("net.ground5hark.sbt" % "sbt-concat" % "0.1.5")
build.sbt
pipelineStages := Seq(concat) Concat.groups := Seq( "style-group.css" -> Seq("css/style1.css", "css/style2.css") )
とやると複数のCSSを1つにまとめられるようです。
assets経由でどうやって呼び出すのかはまだわかっていません。