Aipoのデータの多くはデータベースに保存されますが、
Webメールポートレットで送受信したメールの実体は、
aipo\war\target\aipo\WEB-INF\mail\org001\{user_id}\{account_id}\
のReceiveフォルダとSendフォルダに配置されています。
また、Receiveフォルダ内には、受信済みのメールのUIDを記録しているファイルuid.datがあります。
Webメールポートレットのアカウント設定で「受信済みメッセージは取り込まない」を有効にした場合は、
新しいメールを受信する際に、uid.datに記録されていないUIDのメールだけを受信するようになります。