GAEのプロジェクトでSDKをアップデートするケースは結構頻繁に発生しますが、そうするとjarファイルのパスが通らなくなることがあります。
Slim3で構成している場合、pom.xmlがあるので、Mavenでビルドすることができます。その際に依存関係のあるjarファイルをダウンロードしてくれるので、
mvn install
を実行してjarファイルを取得します。
https://developers.google.com/appengine/docs/java/gettingstarted/creating
