多次元配列でキーを指定して特定のデータを取り出すには、array_column関数が便利です。
第1引数に配列、第2引数に取り出す要素のキー名を指定します。
具体的なコードの書き方は以下のようになります。
$user_data = [ 0 => [ 'id' => 100, 'name' => '太郎', 'created_at' => '2015/01/01' ], 1 => [ 'id' => 101, 'name' => '花子', 'created_at' => '2015/01/02' ] // ... ]; //idのみ取り出す array_column($user_data, 'id'); // => [ // 0 => 100, // 1 => 101 // ]