/etc/pki/tls/certs/ca-bundle.crt
: OS等にバンドルされた信頼できるルート証明書/hoge/intermediate_ca.crt
: 検証するサーバー証明書の中間証明書/fuga/server.crt
: 検証するサーバー証明書
openssl verify -CAfile <(cat /etc/pki/tls/certs/ca-bundle.crt /hoge/intermediate_ca.crt) /fuga/server.crt
参考: openssl – Why can’t I verify this certificate chain? – Super User