Electronで作ったアプリをインストールする時にはexeファイルやdllファイルを以下のようにコピーしています。
ApplyReleasesImpl: Moving file C:\Users\ユーザー名\AppData\Local\hoge\app-1.0.0\lib\net45\node.dll to C:\Users\ユーザー名\AppData\Local\hoge\app-1.0.0\node.dll
当該フォルダにdllファイルがない場合とかは一旦アンインストールして
C:\Users\ユーザー名\AppData\Local\hoge
フォルダを削除した上でインストールし直す必要がありそうです。
また、これらのdllファイルはレジストリには特に書き込まれていないようです。
