MySQLの設定ファイルのパス確認

次のコマンドで確認することができます。

$ mysql --help | grep my.cnf
                      order of preference, my.cnf, $MYSQL_TCP_PORT,
/etc/my.cnf /etc/mysql/my.cnf /usr/etc/my.cnf ~/.my.cnf

左から順番に読み込まれていき、右の設定が上書きをしていきます。