MacのEclipse4.5にPleiadesを導入した際には
Eclipse.app/Contents/Eclipse/eclipse.ini
-Xverify:none -javaagent:../Eclipse/plugins/jp.sourceforge.mergedoc.pleiades/pleiades.jar
の2行を追加します。
その上でcleanオプション付きで起動します。
/Applications/Eclipse.app/Contents/MacOS/eclipse -clean
https://osdn.jp/projects/mergedoc/releases/