Java 7 with Tomcat 7 version 1.4.4 でlogrotateのパスが変わった宣言がされています。
https://aws.amazon.com/releasenotes/AWS-Elastic-Beanstalk/5819471886940272
Log rotation configuration files have been moved from /etc/logrotate.d to /etc/logrotate.elasticbeanstalk.hourly to prevent chron from running the files both daily and hourly (BEANSTALK-5013).
デプロイするアプリケーション内の設定と環境の設定の組み合わせによってはお互いに影響しあってアップデートができなくなる場合があります。
両方に対応した形で書く場合は以下のようにすればよさそうです。
commands: update-logrotate-tomcat7: command: | if [ -f /etc/logrotate.elasticbeanstalk.hourly/logrotate.elasticbeanstalk.tomcat7.conf ]; then sed -i -e "s|^size .*|size 1|g" /etc/logrotate.elasticbeanstalk.hourly/logrotate.elasticbeanstalk.tomcat7.conf fi if [ -f /etc/logrotate.d/logrotate.elasticbeanstalk.tomcat7.conf ]; then sed -i -e "s|^size .*|size 1|g" /etc/logrotate.d/logrotate.elasticbeanstalk.tomcat7.conf fi
なおTomcat Platform Historyは以下にまとまっっています。
http://docs.aws.amazon.com/elasticbeanstalk/latest/dg/platform-history-java.html