問題出ないなーと思ってたら、うるう秒の直後でなく、なぜか30分後にCPU負荷が上がった。
どうもカーネルとJavaのアプリケーションの組み合わせの問題の模様
CentOS6のカーネル
2.6.32-220.23.1.el6.x86_64
と oracle jdk 1.6.0_45 のアプリケーションの組み合わせでした。
なお、
2.6.32-358.23.2.el6.x86_64
では発生しませんでした。
解決方法は
date `date +'%m%d%H%M%C%y.%S'`
でした。
詳しくはこっちですかね
http://www.rack.sh/linux-leap-second/