WordPressではqTranslateというプラグインを使うことで簡単にブログやサイトを多言語化することができます。
このプラグインを利用した上で、テンプレートの分岐をする方法です。
下記はトップページでの分岐方法です。
<?php if (is_home()) { if (qtrans_getLanguage() == 'en') { // English 表記の場合に利用するファイルを読み込む include(TEMPLATEPATH . '/include/home_en.php'); } else { // 日本語表記の場合に利用するファイルを読み込む include(TEMPLATEPATH . '/include/home.php'); } } ?>