e.ctrlKey は Windows ctrlキー、Mac controlキー、e.metaKey は Mac commandキーに割り当てられています。
Windows Ctrl キーあるいは Mac Command キーの判定をさせたい場合
dojo.connect(input, "onkeydown", null, function(e) { if (((e.ctrlKey && !e.metaKey) || (!e.ctrlKey && e.metaKey)) && e.keyCode == 13) { this.form.onsubmit(); } });