MySQL5.5から5.6に乗り換える時、ただ削除してインストールし直すだけだと内容が心配。バックアップをとってから乗り換えます。 mysqldumpを使います。環境はAmazon Linuxです。
$ mysqldump -u root wordpress > dump.sql $ mysql.server stop $ yum remove mysql $ yum install mysql5.6
この後、衝突しているファイルをremoveしつつ、新たに5.6でwordpressというデータベースを作成し、
mysql -uwpuser -p -Dwordpress < dump.sql
で完成。