yumでパッケージをアップデートして権限が戻ったりして阿鼻叫喚なことがありますが、 事前に変更のファイルを以下のコマンドで確認できます。(※影響のある範囲を網羅できているわけではないのでご注意)
rpm -q --qf "[%{FILEMODES:perms} %{FILEUSERNAME}:%{FILEGROUPNAME} %{FILENAMES}\n]" {package}
例
rpm -q --qf "[%{FILEMODES:perms} %{FILEUSERNAME}:%{FILEGROUPNAME} %{FILENAMES}\n]" httpd24
気をつけるのは以下ぐらいかと思います。
httpd
/var/www /var/www/html
php
/var/lib/php/session
