トランザクションのコミットはDatabase.commit()だけではない。

トランザクションの処理をデータベースに反映させるDatabase.commit()ですが、

Database.sql(hoge.class, sql).execute()

のようにSQL文を使ってDBに何らかの変更を加えると、そのタイミングでコミットも行われてしまいます。