EclipseにAptanaをインストールするとPortableGitも一緒にインストールされます。
ただ、Gitの操作はEGitの方が数倍使いやすいので、EGitを使うように設定をします。
環境設定→チーム→Gitから「Automatically attach our git support to projects added that have git repositories」のチェックを外した上でプロジェクトの作成・インポートを行います。
参考
http://qiita.com/itboze/items/35f5c26a7b904cb55b4c
http://kohkimakimoto.hatenablog.com/entry/2013/01/23/203648