rpmforgeやepelなどを使ってyum installを行う際に enablerepoを指定しているのにamzn-updatesからインストールをしようとするケースがあります。
# yum insall --enablerepo=epel hoge
これはpriorityの設定が高く設定されているため、enablerepoを指定してもその指定を無視してpriorityの高いものから取得しようとしているからです。
priorityを下げるか、除外する項目を追記して対応します。
# cat /etc/yum.repos.d/amzn-main.repo [amzn-main] priority=10 enabled=1 exclude=hoge* ←追記する
# cat /etc/yum.repos.d/amzn-updates.repo [amzn-updates] priority=10 enabled=1 exclude=hoge* ←追記する
参考
https://thinkit.co.jp/story/2011/10/25/2318?page=0%2C1
http://dev.classmethod.jp/server-side/os/amazonlinux-yum-priority/