yum install rrdtool rrdtool-perl perl-libwww-perl perl-MailTools perl-MIME-Lite perl-CGI perl-DBI perl-XML-Simple perl-Config-General perl-HTTP-Server-Simple perl-IO-Socket-SSL
を実行した際に
Protected multilib versions: rrdtool-1.3.8-6.el6.i686 != rrdtool-1.4.7-1.el5.rf.x86_64
が表示された場合は素直に
yum remove rrdtool
してから再度インストールをし直します。