SSL証明書を更新してApacheをリスタートすると以下の様なエラーが出ることがあります。
[error] Unable to configure RSA server private key [error] SSL Library Error: XXX error:XXX:x509 certificate routines:X509_check_private_key:key values mismatch
公開鍵、秘密鍵をそれぞれ以下のコマンドで確認してみて、”modulus” 部分と “public exponent” 部分が一致しているか調べます。
openssl x509 -noout -text -in certfile.crt -modulus openssl rsa -noout -text -in private.key-modulus
参考
http://jp.comodo.com/ssl-certificate-support/server_faq/ssl-server-certificate-apache.html