最近個人的にVPSを使ってると、zipをいちいちダウンロードして上げ直すという方法を取らなくなりました。
TeraTermなどコンソールで繋げて下記のコマンドを打ちます。
cd /var/www/html wget http://ja.wordpress.org/wordpress-3.8.1-ja.zip unzip wordpress-3.8.1-ja.zip
cdでWordpressを展開したいディレクトリに移動。
wgetでzipをダウンロード(URLはWordpressサイトで要確認)
unzipで解凍。